巨蜥科：多是一些体形巨大的蜥蜴，其中科摩多巨蜥全长可达4米，是现今最大的蜥蜴。我国只有1种圆鼻巨蜥，全长也有2米多，喜栖水中，尾长而扁，是有力的滑水工具。
屏蜥科：是一类较多原始特征的蜥蜴。其中鳄蜥亚科1属1种，仅分布于我国广西壮族自治区。
蜥蜴科：包括各种麻蜥、草蜥、地蜥等。已知我国有4属25种。麻蜥主要分布于北方干燥环境，草蜥多分布于南方，经常在草丛灌木上活动，体轻尾长，善于攀援。
双足蜥科：它们是营地下穴居生活的蠕虫状蜥蜴，四肢退化，仅雄性残留一对扁平鳍状的后肢。眼退化隐于鳞片之下，耳孔亦退化。
蛇蜥科：是适应地下穴居生活的。体形细长，四肢完全退化，耳孔亦缩小，外形象蛇。
石龙子科：包括各种石龙子、滑蜥、蝘蜓、岛蜥、南蜥等。本科蜥蜴多营地面生活，一般体躯正常，四肢发达，善于在地面奔跑。
